Investigation of the Effects of Cycloastragenol on Arabidopsis Thaliana by High Throughput Sequencing
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2021
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: Wissem Mhiri
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Barbaros Nalbantoğlu
Eş Danışman: Özgür Çakır
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Sikloastragenol (CAG), telomeraz aktivitesini, hücre proliferasyonunu önemli ölçüde uyardığı ve insandaki bazı hastalıkları önlediği kanıtlanmış 'Astragalus membranaceus' dan izole edilen bir moleküldür. Aynı şekilde, bitkiler fizyolojik, biyokimyasal ve moleküler pertürbasyonlara yol açan ve büyümelerini ve gelişimlerini etkileyen farklı stres koşullarına dayanırlar. CAG, bitkiler için bu bozuklukları engellemek ve iyileştirmek için anahtar bir molekül olacaktır. Bu çerçevede, bitkilerde CAG'yi ilk araştıran çalışmamız, bitkilerde farklı çevresel baskıların üstesinden gelmek için, CAG potansiyel yardımını ortaya çıkarmayi, farklı sinyalleşme mekanizmaları üzerindeki CAG etkilerini belirlemeyi, yüksek verimli sıralama metodolojileri aracılığıyla genel bir transkripsiyonel ve transkripsiyon sonrası yanıt analizine sahip olmayı amaçlamaktadır. RNA dizileme ve küçük RNA dizileme stratejilerini ve transkripsiyonel profillerini belirlemek için bilinen ve bilinmeyen küçük RNA'ları değerlendirmek ve etkilenen yollardaki olası işlevlerini değerlendirmek için CAG muamelesi altında A. thaliana kökleri kalluslari kullanılmıştır. Üretilen veriler, sitokrom P450s taşıyıcıları gibi farklı genlerin ve strese duyarlı protein ailelerinin upregülasyonunu ortaya çıkarmıştır. Bununla birlikte, mir3434-5p ve hiperosmotik strese bitki tepkilerini olumlu yönde etkileyen hedef genleri gibi muamele edilen örneklerde, metabolik ve stres toleransı sinyal yolları ile ilişkili birkaç mirna ve hedeflerinin yukarı doğru düzenlendiği bulunmuştur. Anahtar Kelimeler: Yüksek verimli dizileme, Sikloastragenol, RNA dizileme, küçük RNA dizileme, A. thaliana.