FARKLI SÜRELERDE BEKLETİLEN SEMEN ÖRNEKLERİNİN MİKROBİYOM ANALİZİ İLE TANIMLANMASI


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: NURSENA GÜRSOY

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Tülin Özbek

Eş Danışman: Şükriye Karadayı

Özet:

Mikrobiyal parmak izi ve biyolojik örneğin ortama transfer olma zamanına yönelik tespitler cinsel saldırı şüphelisi olan kişinin, daha önce farklı bir nedenle olay mahallinde bulunduğu iddiasını destekleyen ya da desteklemeyen bulgulara ulaşmamızı sağlayabilir. Bu çalışmada olay yeri kurgusu kapsamında, semen örneklerinin iç çevre koşullarında farklı sürelerde bekletilmesiyle adli amaçlı kullanım için mikrobiyom yapısı değişkenliğinin metagenomik analiz yöntemleri ile ortaya konulması amaçlanmaktadır.

Çalışma kapsamında 5 farklı bireyden alınan semen örnekleri polyester kumaş üzerinde leke oluşturularak, 20 gün boyunca bekletilmiştir. 0., 5., 10. ve 20. günlerde kumaş üzerindeki lekelerden alınan toplam 20 örneğin 16S rRNA (V1-V9) gen bölgesi yüksek verimli dizileme ile sekanslanarak veriler üzerinde biyoinformatik analizler gerçekleştirilmiştir. Taksonomik sınıflandırmalar ile alfa ve beta çeşitlilik analizler sonucunda; 5 katılımcıya ait 4 farklı zaman dilimine ait örneklerde; Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes ve Actinobacteria’nın sırasıyla en yüksek oranda (toplam %95’in üzerinde) tespit edilen şubeler oldukları görülmüştür. Semen örneklerindeki mikrobiyota çeşitliliği, iç ortam koşullarına ve zamana bağlı olarak, maruziyetin 10. gününde bir miktar artış gösterse de maruziyetin 20. günündeki mikrobiyota zenginliğinin, maruziyet öncesinden daha düşük olduğu gözlenmiştir. Öte yandan, tüm zamanlardaki örneklerde, mikrobiyal kompozisyon nispeten korunmuştur. Tür düzeyindeki analizlerde ise; bazı bakterilerin zaman içerisinde artık tespit edilemediği buna karşın zamanla yeni bazı bakteri türlerinin saptandığı görülmüştür. Bu bulgular bir olay yerindeki semen lekesinin ev içi ortam koşullarına uzun süreli maruziyet sonrasında dahi tanımlanabilmesi için metagenomik analizlerin kullanılabilme potansiyeli olduğunu göstermektedir. Bununla birlikte tür düzeyindeki değerlendirmeler semen lekesinin yaşı hakkında bize önemli bilgiler sağlayabilmektedir.