Faj Reseptör Bağlayıcı Proteinin Rekombinant Eldesi ve Hedefli Terapötik Nanopartikül Tasarımı


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: SENANUR DOKUZ

Danışman: Tülin Özbek

Özet:

Staphylococcus aureus, salgıladığı birçok toksin ve virülans ile fırsatçı bir

patojen özelliği göstererek konukçusunu istila eder. İmmün sistemden kaçarak

pnömoni, deride enfeksiyon, impertigo, toksik şok sendromu gibi çeşitli

hastalıklara sebep olabilen S.aureus, uzun yıllar antibiyotiklerle tedavi edilmiştir.

Ancak yoğun ve bilinçsiz antibiyotik kullanımınıyla gelişen dirençli S.aureus

suşları günümüzde nozokomiyal enfeksiyonların en önemli nedenlerindendir.

Bakterileri özgül bir şekilde tanıyarak enfekte eden bakteriyofajların terapötik

kullanımı, antibiyotik direnciyle mücadele için çeşitli stratejilerin bir parçası

olmaya uygundur. Bakteriyofajların bakterileri enfekte etmesi, fajların reseptör

bağlayıcı proteinleri (RBP) ile konakçı bakteriler üzerindeki reseptörüne spesifik

ve geri döndürülemez şekilde bağlanması ile başlar. Reseptör bağlayıcı

proteinlerin bakteriyi tanımadaki bu özgüllüğü, hedeflendirilmiş nanopartikül

temelli ilaç taşıma sistemlerinde kullanılabilirliğinin anahtarı olmuştur.

Nanotaşıyıcılar, özellikle hedeflenebilir oluşlarıyla içerdikleri etkin maddenin etki

bölgesine ulaşan konsantrasyonunu arttırarak tedavide gerekli dozajı düşürme,

hedefleri dışındaki bölgelere etkin madde maruziyetini azaltarak yan etkileri


14


indirgeme, biyobozunur ve biyouyumlu oluşu ile güvenli kullanımı, kontrollü ve

sürekli salım yapabilme, etkin madde çözünürlüğünü iyileştirme gibi avantajlara

sahiptirler.

Sunulan tez çalışmasında konakçısı S. aureus olan fajın reseptör bağlayıcı

proteini rekombinant DNA teknolojisi tekniklerinden faydalanılarak eksprese

edilmiş, western blot tekniği ile protein üretimi doğrulanmış ve beklenildiği üzere

53 kDa boyutunda protein tespit edilmiştir. S. aureus-RBP etkileşimi ELISA

yönteminde 450 nm’de alınan absorbans değerlerlerinin bakteri ve protein

konsatrasyonları arttıkça anlamlı bir şekilde artışı ile ve mikroskobik analizlerde

floresan işaretli proteinin S. aureus yüzeyindeki görüntüsü ile kanıtlanmıştır.

Devamında, rifampisin antibiyotiği yüklü PLGA nanopartikülün sentezi ve

karakterizasyonu çalışmaları yapılarak sentezlenen yaklaşık 250 nm, zeta

potansiyeli -30 mV ve PDI değeri 0.3 olan nanopartiküllerin yüzeyine RBP’nin

konjugasyonu gerçekleştirilmiştir. Konjugasyon sonrası üretilen

nanopartiküllerin boyutlarının 300 nm’ye yükseldiği, zeta potansiyellerinin -10

mV ve PDI değerlerinin 0.5 olduğu tespit edilmiştir. Enkapsülasyon etkinliği %35

ve ilaç yükleme kapasiteleri %26 değerlerinde olan nanopartiküllerin

konjugasyon sonrası FT-IR incelemeleri sonucunda 1650 ve 1550 cm -1

bölgelerinde var olan ana amid bantlarınsahip oluşları ile proteinin nanopartikül

yüzeyine dekorasyonu gösterilmiştir. Salım profilleri belirlenen ve antimikrobiyal

etkinlikleri incelenen nanopartiküllerin S. aureus suşlarına karşı MİK

değerlerinin serbest rifampisin ile kıyaslandığında daha düşük olduğu tespit

edilmiştir.