Biyoaktif metabolit üreticisi yeni aktinobakterilerin genomik analizi

Creative Commons License

Ergün H., Ay H.

14. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi , Ankara, Türkiye, 1 - 02 Kasım 2025, ss.1-2, (Özet Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Ankara
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.1-2
  • Yıldız Teknik Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Aktinobakteriler, toprak ve su ekosistemlerinde yaygın olarak bulunan, mikrobiyal çeşitliliğin önemli bir parçasını oluşturan ve özellikle ikincil metabolit üretimindeki rolleriyle dikkat çeken bakterilerdir. Antibiyotikler, enzim inhibitörleri ve pestisitler gibi çok çeşitli biyoaktif bileşikler üreterek hem ekosistemlerdeki madde döngüsüne katkıda bulunurlar hem de farmakolojik ve endüstriyel açıdan büyük bir potansiyele sahiptirler. Günümüzde artan antibiyotik direnci, yeni aktinobakteri türlerinin keşfini ve bunların biyoaktif metabolit üretim potansiyellerinin araştırılmasını daha da önemli hale getirmiştir. Bu bağlamda, çevresel koşulları zorlayıcı olan mağara habitatları, keşfedilmemiş ve metabolik açıdan değerli mikroorganizmaların bulunabileceği önemli ekosistemler arasında yer almaktadır.

Bu çalışmada, Bilecik-İnhisar Mağarası’ndan alınan toprak örneklerinden yeni aktinobakteri suşları izole edilmiş ve bu suşların biyoaktif metabolit üretme kapasitesi genomik yaklaşımlarla araştırılmıştır. Seçici besiyeri kullanılarak elde edilen izolatlar arasından 10 tanesi 16S rRNA gen dizi analizi ile incelenmiş, bunlardan 5 izolatta yeni tür olasılığı tespit edilmiş ve bu suşların tüm genom sekanslama ile biyoinformatik analizleri gerçekleştirilmiştir.

Çalışma sonucunda, genomları dizilenen izolatlar arasında Streptomyces sp. 1M16 ile Streptomyces sp. 1S4’ün aynı genomik tür içerisinde yeni bir türü temsil ettiği, Streptomyces sp. 1R5 ve Jiangella sp. 3R3’ün ise iki ayrı yeni türü temsil ettiği belirlenmiştir. AntiSMASH analizleri, bu izolatların çeşitli antibiyotikler ve diğer biyoaktif metabolitlerin üretiminden sorumlu biyosentetik gen kümeleri içerdiğini göstermiştir. Bu bulgular, söz konusu izolatlardan literatüre yeni aktinobakteri türlerinin kazandırılmasını ve potansiyel biyoaktif metabolit üretim kapasitelerinin ortaya konmasını hedeflemektedir.