Duyurular & Dokümanlar
Dosya İndir
Eğitim Bilgileri
2021 - 2024
2021 - 2024Post Doktora
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Ulusal Nanoteknoloji Araştırma Merkezi, Türkiye
2012 - 2018
2012 - 2018Doktora
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
2013 - 2014
2013 - 2014Yüksek Lisans
Edinburgh Üniversitesi, Biyoteknoloji, İskoçya
2010 - 2012
2010 - 2012Yüksek Lisans
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
2008 - 2010
2008 - 2010Lisans Yandal
Hacettepe Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye
2005 - 2010
2005 - 2010Lisans
Hacettepe Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Gıda Mühendisliği Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2018
2018Doktora
Pichia pastoris alkol dehidrojenaz 2 ve alkol oksidaz 1 promotorlarının transkripsiyon mühendisliği ile rekombinant protein üretimi için geliştirilmesi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı
2014
2014Yüksek Lisans
İstilacı Mikrobiyal Enfeksiyon ve Tedavi Sonucu Koyun Bağırsak Mikrobiyomundaki Tür Bileşimi Değişiklikleri
Yıldız Teknik Üniversitesi
2012
2012Yüksek Lisans
Metabolik mühendislik yöntemleriyle modifiye edilmiş Pichia pastoris kullanılarak transglutaminaz üretimi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
Araştırma Alanları
Yaşam Bilimleri
Biyoteknoloji
Mikrobiyoloji
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Akademik Unvanlar / Görevler
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorDr. Öğr. Üyesi
Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2021 - 2024
2021 - 2024Araştırmacı
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Ulusal Nanoteknoloji Araştırma Merkezi
2022 - 2022
2022 - 2022Araştırmacı
Universitaet für Bodenkultur Wien, Mikrobiyoloji ve Mikrobiyal Biyoteknoloji Enstitüsü
2021 - 2022
2021 - 2022Ücr.Öğretim Görevlisi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü
Akademi Dışı Deneyim
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorManager Editor
Kamuya Bağlı Araştırma Merkezi, TAGEM Dergileri, Biotech Studies, Manager Editor
2014 - 2024
2014 - 2024Mikrobiyal biyoteknoloji uzmanı
Bakanlık, Tarım ve Orman Bakanlığı, TAGEM, Biyoteknoloji Araştırma Merkezi, Mikrobiyal biyoteknoloji uzmanı
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2024
2024Health benefits and risks of fermented foods—the PIMENTO initiative
Todorovic S., Akpinar A., Assunção R., Bär C., Bavaro S. L., Berkel Kasikci M., et al.
Frontiers in Nutrition
, cilt.11, 2024 (SCI-Expanded)
2021
2021What makes Komagataella phaffii non-conventional?
Ata Ö., Ergün B., Fickers P., Heistinger L., Mattanovich D., Rebnegger C., et al.
FEMS Yeast Research
, cilt.21, sa.8, 2021 (SCI-Expanded)
2021
2021Recombinant protein production in Pichia pastoris: From transcriptionally redesigned strains to bioprocess optimization and metabolic modelling
Ergün B., Berrios J., Binay B., Fickers P.
FEMS Yeast Research
, cilt.21, sa.7, 2021 (SCI-Expanded)
2020
2020Engineered Deregulation of Expression in Yeast with Designed Hybrid-Promoter Architectures in Coordination with Discovered Master Regulator Transcription Factor
Ergün B., Demir İ., Özdamar T. H., Gasser B., Mattanovich D., ÇALIK P.
Advanced Biosystems
, cilt.4, sa.4, 2020 (SCI-Expanded)
2019
2019Engineering of alcohol dehydrogenase 2 hybrid-promoter architectures in Pichia pastoris to enhance recombinant protein expression on ethanol
Ergün B., Gasser B., Mattanovich D., ÇALIK P.
Biotechnology and Bioengineering
, cilt.116, sa.10, ss.2674-2686, 2019 (SCI-Expanded)
2017
2017Double promoter expression systems for recombinant protein production by industrial microorganisms
Öztürk S., Ergün B., ÇALIK P.
Applied Microbiology and Biotechnology
, cilt.101, sa.20, ss.7459-7475, 2017 (SCI-Expanded)
2016
2016Lignocellulose degrading extremozymes produced by Pichia pastoris: Current status and future prospects
Gündüz Ergün B., ÇALIK P.
Bioprocess and Biosystems Engineering
, cilt.39, sa.1, ss.1-36, 2016 (SCI-Expanded)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2022
2022Second generation Pichia pastoris strain and bioprocess designs
Ergün B., Laçın K., Çaloğlu B., Binay B.
Biotechnology for Biofuels and Bioproducts
, cilt.15, sa.1, 2022 (Scopus)
2021
2021Interactions between Teladorsagia circumcincta Infections and Microbial Composition of Sheep with or without Successful Monepantel Treatment—A Preliminary Study
Watkins C. A., Bartley D. J., Ergün B., Yıldızhan B., Ross-Watt T., Morrison A. A., et al.
Ruminants
, cilt.1, sa.1, ss.31-45, 2021 (Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2024
2024Living biocatalysts
Gündüz Ergün B.
EBDays2024/5th International Enzyme and Bioprocess Days, EBDays2024, İzmir, Türkiye, 27 - 29 Ağustos 2024, ss.20, (Özet Bildiri)
2023
2023Synthetic Control over Pichia pastoris Expression System: From Promoter Engineering to Transcriptional Circuitry Redesign
Gündüz Ergün B., Gasser B., Mattanovich D., Çalık P.
RPP11 / 11th Conference on Recombinant Protein Production, Girona, İspanya, 17 - 19 Ekim 2023, ss.103
2023
2023Living Therapeutic Design for Pernicious Anemia by Engineering Probiotic Yeast with Synthetic Biology Approaches
Gündüz Ergün B., Albayrak D., Şeker U. Ö. Ş.
FEMS 2023 / 10th Congress of European Microbiologists, Hamburg, Almanya, 9 - 13 Temmuz 2023, ss.1104
2022
2022Novel genetic tools for Pichia pastoris strain engineering
Gündüz Ergün B.
EBDays2022/3rd International Enzyme and Bioprocess Days, Tokat, Türkiye, 9 - 11 Eylül 2022, ss.23
2017
2017Yr15 Screening of Turkish Bread Wheat Varieties Using KASP Markers for Warrior, A New Race of Stripe Rust Pathogen (Puccinia striiformis) on Wheat in Turkey
Ölmez F., Akan K., Maraş Vanlıoğlu F., Uslu T., Gündüz Ergün B.
Plant Health: Challenges Solutions, Antalya, Türkiye, 23 - 28 Nisan 2017, ss.41, (Özet Bildiri)
2016
2016Potential applications of transglutaminase enzyme in cereal products
Gündüz Ergün B.
15th ICBC/15th International Cereal and Bread Congress, İstanbul, Türkiye, 16 - 21 Nisan 2016, ss.189, (Özet Bildiri)
2016
2016Extracellular microbial pro-transglutaminase production by recombinant Pichia pastoris
Gündüz Ergün B.
Pichia 2016, Antalya, Türkiye, 3 - 06 Nisan 2016, ss.63
2012
2012Recombinant transglutaminase production by metabolically engineered Pichia pastoris
Gündüz Ergün B., Yılmaz R., Çalık P.
ECB15/15th European Congress on Biotechnology, İstanbul, Türkiye, 23 - 26 Eylül 2012, ss.80
2012
2012Transglutaminase Production Using Modified Pichia pastoris with Metabolic Engineering
Gündüz Ergün B., Çalık P.
International Food, Agriculture and Gastronomy Congress, Antalya, Türkiye, 15 - 19 Şubat 2012, ss.245-246
Kitaplar
2021
2021Hybrid architectured promoter design to engineer expression in yeast
Gündüz Ergün B., Çalık P.
Methods in Enzymology - Recombinant Protein Expression: Eucaryotic Hosts, William B O'Dell,Zvi Kelman, Editör, Academic Press , London, ss.81-104, 2021
2019
2019Hybrid-architectured promoter design to deregulate expression in yeast
Gündüz Ergün B., Çalık P.
Methods in Enzymolology - Recombinant Protein Expression: Eukaryotic Hosts, WILLIAM B. O’DELL,ZVI KELMAN, Editör, Academic Press , London, ss.105-128, 2019
2019
2019Established and upcoming yeast expression systems
Gündüz Ergün B., Çelik Akdur E., Çalık P.
Recombinant Protein Production in Yeast, Brigitte Gasser,Diethard Mattanovich, Editör, Humana Press, Inc. , New York, ss.1-74, 2019
Desteklenen Projeler
2025 - 2027
2025 - 2027
Süt Proteinlerinlerinden Laktoferrin Ve Osteopontinin Komagatella Phaffii Kullanılarak Hassas Fermantasyon Ile Üretimi Ve Labne Peyniri Modeli Denemesi
TÜBİTAK Projesi
Gündüz Ergün B., Güneş Altuntaş E.(Yürütücü)
2023 - 2026
2023 - 2026
Fonksiyonel Gıda Uygulamaları İçin Sentetik Biyoloji Yaklaşımı ile Anne Sütü Oligosakkariti Üreten Probiyotik Bakteri Suşunun Tasarlanması
TÜBİTAK Projesi
(Proje Özeti)
Gündüz Ergün B. (Yürütücü), Şeker U. Ö. Ş., Özkul Koçak C.(Yürütücü), Dudak Şeker F. C.
2023 - 2026
2023 - 2026
Crispr/Cas9 Gen Düzenleme Teknolojisi ile ß-Glukozidaz Enzim Aktivitesi Yüksek Lactobacillus plantarum Türünün Geliştirilmesi, Bu Türün ve Yüksek Aktiviteye Sahip Serbest ve Immobilize ß-Glukozidaz Enziminin Sofralık Zeytin Üretiminde Kullanılması,
TÜBİTAK Projesi
Gündüz Ergün B., Elibol M.(Yürütücü), Şener Mumcu A.(Yürütücü), Güneş Altuntaş E.
2023 - 2026
2023 - 2026
CRISPR/dCas9-Temelli Transkripsiyon Faktörü Tasarımları ile Sentetik Kontrollü Rekombinant Protein Üretim Sistemi İçin Yeni Nesil Pichia Pastoris Konakçı Geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Gündüz Ergün B., Şeker U. Ö. Ş.(Yürütücü)
2023 - 2024
2023 - 2024
Makarnada Ekmeklik Buğday (Triticum aestivum) Tespiti ve Miktar Tayini Sağlayan RT-qPCR Kiti Geliştirilmesi
TAGEM Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü Projesi
Gündüz Ergün B. (Yürütücü)
2022 - 2024
2022 - 2024
Yaşayan İlaç Sistemleri İçin Probiyotik Maya Konakçı Hücre Geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Gündüz Ergün B. (Yürütücü), Şeker U. Ö. Ş.
2018 - 2023
2018 - 2023
Ege Bölgesi Rhizobium Bakteri Suşlarının Toplanması, Değerlendirilmesi ve Seleksiyonu
TAGEM Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü Projesi
Gündüz Ergün B.
2018 - 2023
2018 - 2023
Gıda Endüstrisinde Yüksek Potansiyele Sahip Transglutaminaz Enzimi Üretimi İçin Pichia pastoris Mayası ile Biyoproses Geliştirilmesi
TAGEM Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü Projesi
Gündüz Ergün B. (Yürütücü)
2017 - 2019
2017 - 2019
Pichia pastoris Alkol Dehidrojenaz-1 Promotorunun Geliştirilmesi ve Tasarlanmış Promotor ile Terapötik Protein Üretiminin Artırılması
TÜBİTAK Projesi
Çalık P.(Yürütücü)
Patent
2024
2024PROMOTOR MÜHENDİSLİĞİ İLE ALKOL DEHİDROJENAZ 2 (ADH2) PROMOTOR VARYANTLARI TASARIMI
Patent
Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: US12091658B2 , Standart Tescil
2019
2019MODİFİYE AOX1 PROMOTÖR VARYANTLARI
Patent
Başvuru Yapıldı, Buluşun Başvuru Numarası: PCT/TR2019/050783 , Standart Tescil
Ödüller
Ekim 2024
Ekim 2024
ISIF’24 9. Uluslararası Buluş Fuarında Gümüş Madalya
Tc Teknoloji Ve Sanayi Bakanlığı
Şubat 2022
Şubat 2022
FEMS Yeast Research 2021 yılı en iyi makale ödülü
Fems Yeast Research Editorial Board
Haziran 2014
Haziran 2014
ODTÜ Lisanüstü Ders Performans Ödülü (Doktora)
Orta Doğu Teknik Üniversitesi
Haziran 2012
Haziran 2012
ODTÜ Lisanüstü Ders Performans Ödülü (Yüksek Lisans)
Orta Doğu Teknik Üniversitesi
Burslar
2022 - 2024
2022 - 2024TÜBİTAK Yurt İçi Doktora Sonrası Araştırma Bursu
TÜBİTAK
2023 - 2023
2023 - 2023AB COST Aksiyonu CA18229 Yeast4Bio ITC Konferans Katılım Bursu
Avrupa Birliği Komisyonu
2023 - 2023
2023 - 2023TÜBİTAK 2224 Yurt Dışı Bilimsel Toplantılara Katılım Bursu
TÜBİTAK
2022 - 2022
2022 - 2022Yeast4Bio COST Aksiyonu Kısa Süreli Bilimsel Misyon Desteği
Avrupa Birliği Komisyonu
2017 - 2018
2017 - 2018TÜBİTAK 2214 Yurt Dışı Doktora Sırası Araştırma Bursu
TÜBİTAK
2014 - 2016
2014 - 2016TUBİTAK 2211 Yurt İçi Doktora Bursu
TÜBİTAK
2013 - 2014
2013 - 2014Milli Eğitim Bakanlığı Yurtdışı Yüksek Lisans Bursu (YLSY)
Milli Eğitim Bakanlığı
2010 - 2012
2010 - 2012