Biyografi
Prof. Dr. Ali AKPEK Karşıyaka İzmir doğumludur. Lisans eğitimini Başkent Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği bölümünde tamamlamıştır. Türkiye'nin ilk biyomedikal mühendislerinden birisidir. Lisans eğitimi biyomedikal elektronik üzerine olmuştur. Yüksek lisans eğitimini Prof. Dr. Mustafa Ahmet ÖZTARHAN danışmanlığında Ege Üniversitesi Biyoteknoloji Anabilim Dalında tamamlamıştır. Burada yüzey mühendisliği, nanoionics ve mikrobiyoloji alanında çalışmıştır. Doktora eğitimi için Monbukagakusho (Japon Hükümet Bursu) desteği ile tam burslu olarak Japonya'ya gitmiştir. Tokyo Üniversitesi'nde (University of Tokyo) Biyonanoteknoloji alanında bir yıl araştırmacı olarak hücre füzyonu ve nanolitografi üzerine çalıştıktan sonra Tokyo Teknoloji Enstitüsü'nde (Tokyo Institute of Technology) Mikro-Mekatronik Mühendisliği (Mechano-Micro Engineering) bölümünde Prof. Dr. Toshiharu KAGAWA danışmanlığında doktora eğitimini tamamlamıştır. Yapay kalp, akışkanlar mekaniği, kütle ısı transferi alanlarında araştırmalarda bulunmuştur.
Doktora eğitiminden sonra yine tam burslu olarak Prof. Dr. Ali KHADEMHOSSEINI gözetiminde Harvard Üniversitesi ve Massachusetts Teknoloji Enstitüsü'nde (Harvard University-Massachusetts Institute of Technology Division of Health Science and Technology, Harvard Medical School, Brigham and Women's Hospital) ziyaretçi profesör (visiting assistant professor) olarak görev yapmıştır. Burada doku mühendisliği, mikroakışkan cihazlar, yenilikçi biyomalzemeler ve rejeneratif tıp uygulamaları geliştirilmesi üzerine araştırmalarda bulunmuştur.
Türkiye'de İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi'nde biyomedikal mühendisliği bölümünde Yardımcı Doçent Doktor olarak görev yaptıktan sonra Gebze Teknik Üniversitesi biyomühendislik bölümüne geçmiştir. Burada 4 yıl kadar Dr. Öğretim Üyesi ve Doçent Doktor olarak görev yaptıktan sonra Yıldız Teknik Üniversitesi biyomedikal mühendisliği bölümüne geçmiştir. Hâlâ burada çalışmaktadır. 2018-2021 yılları arasında Sabancı Üniversitesi Nanoteknoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi'nde yarı zamanlı araştırmacı olarak görev yapmıştır.
İstanbul Teknik Üniversitesi'nde 2022-2023 yılları arasında Executive MBA (Yöneticiler için İşletme) Yüksek lisans programını tamamlamıştır.
50'den fazla akademik yayın gerçekleştirmiştir. Bu yayınlarına bugüne kadar (Aralık 2023) 1500'ün üzerinde atıf yapılmıştır. Güncel (Aralık 2023) h-indeksi 14 ve i-10 indeksi 21'dir (Google Scholar ID Pm9pObEAAAAJ). Araştırma laboratuvarı ve detaylı bilgi için www.alialab.com.
2015 yılından bu yana Alia Girişim Mühendislik ve Danışmanlık adı altında tıbbi cihaz ve ürünlerin ar&ge ve ticarileştirme aşamalarında çalışmalarda bulunmaktadır. Bu kapsamda sayısız proje üzerinde çalışılmıştır. Firma son dönemlerde biyoteknoloji alanında faaliyet gösteren bir özel sermaye fonuna dönüşmeye çalışmaktadır. Detaylı bilgi için www.alia.com.tr.
Bugüne kadar Türkiye'de üretimi ya hiç gerçekleştirilmeyen ya da çok sınırlı sayıda gerçekleştirilen tamamı yüksek teknoloji sınıfına ait ve tamamı biyoteknoloji ürünü 10+ ürünü TRL-0 seviyesinden TRL-9 seviyesine getirmiş ve ticarileştirmiştir. Ürünler başarı ile pazara sunulmuş, satış gerçekleştirilmiş ve ithalat ikamesi temin edilmiştir.
Anadil seviyesinde İngilizce, iyi seviyede (konuşma ve dinleme) Japonca bilmektedir.
Evli ve bir kız çocuğu babasıdır.
Eğitim Bilgileri
2022 - 2023
2022 - 2023Yüksek Lisans
İstanbul Teknik Üniversitesi, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Executive MBA, Türkiye
2015 - 2016
2015 - 2016Post Doktora
Harvard University, Tıp Fakültesi, Tıp Fakültesi, Amerika Birleşik Devletleri
2015 - 2016
2015 - 2016Post Doktora
Massachusetts Institute of Technology, Division of Health Science and Technology, Division of Health Science and Technology, Amerika Birleşik Devletleri
2011 - 2014
2011 - 2014Doktora
Tokyo Institute of Technology, Graduate School of Science and Engineering, Mechano-Micro Engineering, Japonya
2008 - 2009
2008 - 2009Yüksek Lisans
Ege Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji, Türkiye
2001 - 2006
2001 - 2006Lisans
Başkent Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2023
2023Doktora
KOYUN KALP KAPAKÇIĞININ HÜCRESİZLEŞTİRİLMESİYLE REJENERATİF İNSAN KALP KAPAKÇIĞININ GELİŞTİRİLMESİ VE ETKİNLİĞİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ
Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik
2020
2020Yüksek Lisans
Design and development of a personalized medicine oriented microfluidic organ on a chip platform
Gebze Teknik Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı (Disiplinlerarası)
2018
2018Yüksek Lisans
Elektrikli lineer eyleyiciyle oluşturulan mekanik sistem ile TPR 20/10 doz ölçümü ve standart değerler ile karşılaştırılması
İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü
Yabancı Diller
C2 Ustalık
C2 Ustalıkİngilizce
B2 Orta Üstü
B2 Orta ÜstüJaponca
Araştırma Alanları
Biyomedikal Mühendisliği
Mühendislik ve Teknoloji
Akademik Unvanlar / Görevler
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorProf. Dr.
Yıldız Teknik Üniversitesi, Elektrik-Elektronik Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği
2021 - 2024
2021 - 2024Doç. Dr.
Yıldız Teknik Üniversitesi, Elektrik-Elektronik Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği
2018 - 2021
2018 - 2021Doç. Dr.
Gebze Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü
2017 - 2018
2017 - 2018Dr. Öğr. Üyesi
Gebze Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü
2014 - 2017
2014 - 2017Dr. Öğr. Üyesi
İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi, Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü
2015 - 2016
2015 - 2016Dr. Öğr. Üyesi
Harvard University
2015 - 2016
2015 - 2016Dr. Öğr. Üyesi
Massachusetts Institute of Technology
2011 - 2014
2011 - 2014Araştırma Görevlisi
Tokyo Institute of Technology, Graduate School of Science and Engineering, Mechano-Micro Engineering
2010 - 2011
2010 - 2011Araştırmacı
Tokyo University, Bioengineering, Bionanotechnology
Verdiği Dersler
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2024
2024Advances in xenogeneic donor decellularized organs: A review on studies with sheep and porcine-derived heart valves
Inal M. S., AVCI H., Hassan S., DARCAN C., Shin S. R., AKPEK A.
Bioengineering and Translational Medicine
, cilt.9, sa.6, 2024 (SCI-Expanded)
2024
2024Molecular Separation by Using Active and Passive Microfluidic chip Designs: A Comprehensive Review
Ebrahimi A., İÇÖZ K., Didarian R., Shih C., Tarim E. A., Nasseri B., et al.
Advanced Materials Interfaces
, cilt.11, sa.2, 2024 (SCI-Expanded)
2024
2024In vitro recellularization and characterization of sheep pulmonary valves after decellularization for preclinical studies Koyun pulmoner kalp kapakçıklarının hücresizleştirilmesi sonrası preklinik çalışmalar için in vitro olarak yeniden hücrelendirilmesi ve karakterizasyonu
İnal M. S., DARCAN C., AKPEK A.
Journal of the Faculty of Engineering and Architecture of Gazi University
, cilt.40, sa.1, ss.515-527, 2024 (SCI-Expanded)
2023
2023Detailed Analysis of the Effects of Viscosity Measurement Errors Caused by Heat Transfer during Continuous Viscosity Measurements under Various Temperature Changes and the Proposed Solution of a Non-Dimensional Parameter Called the Akpek Number
AKPEK A.
Applied Sciences (Switzerland)
, cilt.13, sa.19, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023Eggshell integrated GelMA/CSMA/HyMA hybrid hydrogels for cell therapy/tissue engineering
Yüce-Erarslan E., İzbudak B., Kızılkurtlu A. A., Topal M., AKPEK A., Bal-Öztürk A.
Journal of Applied Polymer Science
, cilt.140, sa.34, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023Characterization of a Decellularized Sheep Pulmonary Heart Valves and Analysis of Their Capability as a Xenograft Initial Matrix Material in Heart Valve Tissue Engineering
İnal M. S., DARCAN C., AKPEK A.
Bioengineering
, cilt.10, sa.8, 2023 (SCI-Expanded)
2021
2021Current Strategies for the Regeneration of Skeletal Muscle Tissue
ALARÇİN E., Bal-ozturk A., AVCI H., GHORBANPOOR H., DOĞAN GÜZEL F., AKPEK A., et al.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
, cilt.22, sa.11, 2021 (SCI-Expanded)
2021
2021Tissue adhesives: From research to clinical translation
Bal-Ozturk A., Cecen B., Avci-Adali M., Topkaya S. N., ALARÇİN E., YAŞAYAN G., et al.
NANO TODAY
, cilt.36, 2021 (SCI-Expanded)
2021
2021Analysis of Surface Properties of Ag and Ti Ion-Treated Medical Textiles by Metal Vapor Vacuum Arc Ion Implantation
AKPEK A.
COATINGS
, cilt.11, sa.1, 2021 (SCI-Expanded)
2019
20193D Bioprinting: from Benches to Translational Applications
Heinrich M. A., Liu W., Jimenez A., Yang J., Akpek A., Liu X., et al.
SMALL
, cilt.15, sa.23, 2019 (SCI-Expanded)
2019
2019Development of a heart assist device as a vibrational viscometer that estimates blood viscosity
Akpek A.
JOURNAL OF THE FACULTY OF ENGINEERING AND ARCHITECTURE OF GAZI UNIVERSITY
, cilt.34, sa.1, ss.235-246, 2019 (SCI-Expanded)
2019
2019A novel design of an electromagnetically levitated vibrational viscometer for biomedical and clinical applications
Akpek A.
TURKISH JOURNAL OF ELECTRICAL ENGINEERING AND COMPUTER SCIENCES
, cilt.27, sa.2, ss.819-831, 2019 (SCI-Expanded)
2018
2018Recent advances in organ-on-a-chip technologies and future challenges: a review
AVCI H., DOĞAN GÜZEL F., EROL S., Akpek A.
TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY
, cilt.42, sa.3, ss.587-610, 2018 (SCI-Expanded)
2018
2018Lung on a Chip for Drug Screening and Design
Kizilkurtlu A. A., Polat T., Aydin G. B., Akpek A.
CURRENT PHARMACEUTICAL DESIGN
, cilt.24, sa.45, ss.5386-5396, 2018 (SCI-Expanded)
2018
2018Analysis of biocompatibility characteristics of stereolithography applied three dimensional (3D) bioprinted artifical heart valves
Akpek A.
JOURNAL OF THE FACULTY OF ENGINEERING AND ARCHITECTURE OF GAZI UNIVERSITY
, cilt.33, sa.3, ss.929-938, 2018 (SCI-Expanded)
2017
20173D Printed Anchoring Sutures for Permanent Shaping of Tissues
Wei W., Li Y., Yang H., Nassab R., Shahriyari F., Akpek A., et al.
MACROMOLECULAR BIOSCIENCE
, cilt.17, sa.12, 2017 (SCI-Expanded)
2017
2017Extrusion Bioprinting of Shear-Thinning Gelatin Methacryloyl Bioinks
Liu W., Heinrich M. A., Zhou Y., Akpek A., Hu N., Liu X., et al.
ADVANCED HEALTHCARE MATERIALS
, cilt.6, sa.12, 2017 (SCI-Expanded)
2017
20174D bioprinting: the next-generation technology for biofabrication enabled by stimuli-responsive materials
Li Y., Zhang Y. S., Akpek A., Shin S. R., Khademhosseini A.
BIOFABRICATION
, cilt.9, sa.1, 2017 (SCI-Expanded)
2016
2016Effect of non-uniform temperature field in viscosity measurement
Akpek A.
JOURNAL OF VISUALIZATION
, cilt.19, sa.2, ss.291-299, 2016 (SCI-Expanded)
2014
2014Modification of anti-bacterial surface properties of textile polymers by vacuum arc ion source implantation
Nikolaev A. G., Yushkov G. Y., Oks E. M., Oztarhan A., Akpek A., Hames-Kocabas E., et al.
APPLIED SURFACE SCIENCE
, cilt.310, ss.51-55, 2014 (SCI-Expanded)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2017
2017Three Dimensional (3D) Fabrication of Multilayered Heart Valve Tissues by Stereolithography technique
Akpek A.
21st National Biomedical Engineering Meeting (BIYOMUT), İstanbul, Türkiye, 24 Kasım - 26 Aralık 2017
2017
2017Three Dimensional Bioprinting of Tissue Engineered Artificial Heart Valves by Stereolithography
Akpek A.
21st National Biomedical Engineering Meeting (BIYOMUT), İstanbul, Türkiye, 24 Kasım - 26 Aralık 2017
2016
2016Design of a System That Measures the Effect of Environmental Temperature on Ultrasonic Nebulizers
Sari S., Akpek A.
National Conference on Electrical, Electronics and Biomedical Engineering (ELECO), Bursa, Türkiye, 1 - 03 Aralık 2016, ss.491-495
2016
2016A Medical Waste Management Model for Public Private Partnership Hospitals
Kocak O., Kurtuldu H., Akpek A., Kocoglu A., Erogul O.
Medical Technologies National Conference (TIPTEKNO), Antalya, Türkiye, 27 - 29 Ekim 2016, (Tam Metin Bildiri)
2016
2016New Concept Design of an Insulin Pen for Visually Impaired or Blind Diabetius Mellitus Patients
Ucar T., Kocak O., Akpek A.
Medical Technologies National Conference (TIPTEKNO), Antalya, Türkiye, 27 - 29 Ekim 2016
2015
2015A New Algorithm for Segmentation and Fracture Detection in X-Ray Images
Bulut S., Ozcinar A., Ciftcioglu C., Akpek A.
Medical Technologies National Conference (TIPTEKNO), Bodrum, Türkiye, 15 - 18 Ekim 2015
2015
2015Remote Control of Centrifuge and Injection Systems via MATLAB and ARDUINO
Ciftcioglu C., Kocak O., Akpek A.
Medical Technologies National Conference (TIPTEKNO), Bodrum, Türkiye, 15 - 18 Ekim 2015
2015
2015Electronic Pillbox Design for Demantia Patients.
Cebeci S. A., Ciftcioglu C., Kocak O., Akpek A.
Medical Technologies National Conference (TIPTEKNO), Bodrum, Türkiye, 15 - 18 Ekim 2015
2016
2016Design and Analysis of an Autoclave Simulation Using MATLAB/Simulink
Altinsu B., Kocak O., Akpek A.
Medical Technologies National Conference (TIPTEKNO), Antalya, Türkiye, 27 - 29 Ekim 2016
2013
2013Temperature Measurement Control Problem of Vibrational Viscometers Considering Heat Generation and Heat Transfer Effect of Oscillators
Akpek A., Youn C., Kagawa T.
9th Asian Control Conference (ASCC), İstanbul, Türkiye, 23 - 26 Haziran 2013
Kitaplar
2021
2021KİŞİSELLEŞTİRİLMİŞ TIP TEKNOLOJİSİ VE UYGULAMALARI
Akpek A.
SAĞLIKTA SON TRENDLER, Can ÖZLÜ, Editör, Akademi Kitabevi Yayınları, İstanbul, ss.663-680, 2021
2021
2021Polimerlerin Medikal Amaçlı Kullanımları
Akpek A.
Polimerler: Özellikleri ve Uygulamaları, Hüseyin AVCI, Editör, ESOGÜ Basımevi, Eskişehir, ss.205-224, 2021
2019
2019Yapay Organlar
Akpek A.
Biyomedikal Mühendisliği ve Uygulamaları, Onur Koçak; Osman Eroğlu, Editör, Elektrik Mühendisleri Odası Yayınevi, Ankara, ss.525-542, 2019
Desteklenen Projeler
2024 - 2024
2024 - 2024DERİN YANIK DOKULARI İÇİN IN SITU 3B ELEKTROEĞİRME YÖNTEMİ İLE TASARLANMIŞ BİR FANTOM DOKU MODELİ ÜZERİNDE ÇOK KATMANLI DERİ DOKUSU BİYOFABRİKASYONU
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
AKPEK A. (Yürütücü), SEZGİN E.
2022 - 2024
2022 - 2024Mikroakışkan bir Çip üstü Miyokard Enfarktüs Platformu Tasarımlanması ve Kalp Krizlerinin In Vitro Olarak Modellenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
AKPEK A. (Yürütücü), GÜREL PEKÖZER G., TRABZON L.
2021 - 2024
2021 - 2024Tümleşik bir Çip üstü Kardiyovasküler Sistem Platformunun Tasarımlanması ve Geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A. (Yürütücü)
2022 - 2023
2022 - 2023KOZMETİK VE İLAÇ GELİŞTİRME ÇALIŞMALARI İÇİN ÇİP ÜSTÜ DERİ SİSTEMİ TASARLANMASI VE GELİŞTİRİLMESİ
TÜBİTAK Projesi
Akpek A. (Yürütücü)
2022 - 2023
2022 - 2023Mikroekstrüzyon biyoyazıcı aracılığı ile in situ kemik doku biyofabrikasyonu
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Bozkurt E.(Yürütücü)
2022 - 2023
2022 - 2023Mısır nişastası ve kolajen bazlı viskoelastik özellikleri ayarlanabilir, düşük maliyetli, enkejte edilebilir doku yapıştırıcısı geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Kaya Ş.(Yürütücü)
2021 - 2023
2021 - 2023Kardiyovasküler Cerrahide Kullanılmak Üzere Ksenogreft Kalp Kapakçığının Deselülerizasyon Ertesi Altın Nanoparçacıkları ile İmplantasyonu ve Riboflavin/Heparin Kaplanması Sonrasında İnsan Hücreleri ile Reselülerizasyonu
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
AKPEK A. (Yürütücü), ÖNDER S., DARCAN C., İnal M. S., GÜREL PEKÖZER G., ÖZTÜRK A. B., et al.
2021 - 2023
2021 - 2023AĞIR YANIK, AĞIR YARALANMA YA DA DERİ HASTALIKLARI TEDAVİSİ İÇİN KULLANILACAK DERİ EŞDEĞERİ BİYOFABRİKASYONU
TÜBİTAK Projesi
Akpek A. (Yürütücü)
2021 - 2022
2021 - 2022Yapay kemik uygulamları için yeni nesil biyomalzeme geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Tiryaki A.(Yürütücü)
2021 - 2022
2021 - 2022In situ biyobaskı yöntemi ile 3B yara örtüsü biyofabrikasyonu
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Özçelik A.(Yürütücü)
2020 - 2021
2020 - 2021Yapay deri uygulamaları için yeni nesil biyomalzeme geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Yüncü N. Ş.(Yürütücü)
2018 - 2021
2018 - 2021Kıkırdak ve Kemik Rejenerasyonu İçin 3-Boyutlu Biyoyazıcı Teknolojisi ile Biyomimetik Nanohibrit Doku İskelelerinin Geliştirilmesi ve in vivo Osteokondral Hasar Modelinde Değerlendirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Öztürk A. B.(Yürütücü)
2018 - 2021
2018 - 2021Kemik Hasarlarının Tedavisi İçin Üç Boyutlu Baskılama Yöntemi İle İlaç Taşıyıcı Doku İskelelerinin Hazırlanması, In Vitro Karakterizasyonu Ve In Vivo Kalvaryal Kemik Hasarı Modelinde Değerlendirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Alarçin E.(Yürütücü)
2019 - 2020
2019 - 2020Kalp dokusu için yeni nesil biyomalzeme geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., Akharman E.(Yürütücü)
2018 - 2019
2018 - 2019Masaüstü Delta Tipi Süratli Multimateryal 3B Biyoyazıcının Geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Akpek A., - -.(Yürütücü)
2018 - 2019
2018 - 20193B Biyonik kol ünitesine deri dokusu üretimi gerçekleştirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
Akpek A. (Yürütücü)
2018 - 2019
2018 - 2019Çok Katmanlı Deri Dokularının 3b Biyoyazıcılar Aracılığı Ile Üretilmesi, Mikroakışkan Biyoreaktörler Ile Geliştirilmesi, Çip Üzerine Deri Uygulamaları Için Değerlendirilmesi Ve Biyonik Kol Uygulamaları Için Olası Kullanımlarının Araştırılması
TÜBİTAK Projesi
Akpek A. (Yürütücü)
2015 - 2016
2015 - 2016Stereolitografi aracılığı ile 3B kalp kapakçıkları tasarımı ve geliştirilmesi
Diğer Ülkelerden Üniversiteler Tarafından Desteklenmiş Proje
Akpek A. (Yürütücü)
2015 - 2016
2015 - 2016