Eğitim Bilgileri
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorDoktora
Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2022
2022Yüksek Lisans
ACE2 RESEPTÖRÜNÜN TAHMİNİ MUTASYON NOKTALARININ VE ETKİLERİNİN İN SİLİCO OLARAK BELİRLENMESİ
Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
Sertifika, Kurs ve Eğitimler
2022
2022Afet ve Acil Durum Eğitimi
İş Sağlığı ve Güvenliği
Yıldız Teknik Üniversitesi
2022
20222.Computer-Aided Drug Design Symposium and Workshop
Kişisel Gelişim
Biruni Üniversitesi
2021
2021CRISPR-cas: Gen Düzenleme Uygulamaları
Kişisel Gelişim
Hacettepe Üniversitesi Uluslararası Gıda Biyogüvenlik ve Biyoteknoloji Merkezi(IFBBC)
Araştırma Alanları
Yaşam Bilimleri
Biyoinformatik
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Akademik Unvanlar / Görevler
2021 - Devam Ediyor
2021 - Devam EdiyorAraştırma Görevlisi
Yıldız Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2020 - 2021
2020 - 2021Araştırma Görevlisi
Afyon Kocatepe Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2024
2024Identification of potential antigenic proteins and epitopes for the development of a monkeypox virus vaccine: an in silico approach
Aktaş E., Sezerman O. U., Özer M., Kırboğa K. K., Köseoğlu A. E., Özdemir Özgentürk N.
MOLECULAR DIVERSITY
, 2024 (SCI-Expanded)
2024
2024A comprehensive Study of Juglone's Effect on Polyphenol Oxidase in Cucumber: In Vitro Experiments and Computational Docking and Dynamics Insights
Kocaçalışkan İ., Vural Korkut Ş., Aktaş E., Yalçın M., Özdemir Özgentürk N.
PHYSIOLOGIA PLANTARUM
, cilt.176, sa.0031-9317, ss.1-13, 2024 (SCI-Expanded)
2024
2024A comprehensive examination of ACE2 receptor and prediction of spike glycoprotein and ACE2 interaction based on in silico analysis of ACE2 receptor
Aktaş E., Özgentürk N. Ö.
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE AND DYNAMICS
, cilt.42, sa.9, ss.4412-4428, 2024 (SCI-Expanded)
2023
2023Bioinformatic investigation of Nipah virus surface protein mutations: Molecular docking with Ephrin B2 receptor, molecular dynamics simulation, and structural impact analysis
Aktaş E., Saygılı İ., Kahveci E., Tekbıyık Z., Özgentürk N. Ö.
MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
, cilt.67, sa.12, ss.501-513, 2023 (SCI-Expanded)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
2025Bioinformatics-Driven Structural and Pharmacological Analysis of SLITRK1 in Tourette Syndrome: Impact of S656M Mutation Using Molecular Dynamics, Docking, and Reinforcement Learning
Aktaş E., İslim A. R., Kırboğa K. K., Yıldız D., Özdemir Özgentürk N., Rudrapal M., et al.
Computation , cilt.13, sa.2, ss.1-27, 2025 (ESCI)
2022
2022Revealing In Silico that Bacteria’s Outer Membrane Proteins may Help our Bodies Replicate and Carry Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2
Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
Bioinformatics and Biology Insights
, cilt.16, ss.1-7, 2022 (ESCI)
2021
2021Bioinformatic analysis reveals that some bacteria may aid SARS-CoV-2 spread and entry into host cells
Aktas E., Korcan S. E., ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK N., Erismis U. C.
SIGMA JOURNAL OF ENGINEERING AND NATURAL SCIENCES-SIGMA MUHENDISLIK VE FEN BILIMLERI DERGISI
, cilt.39, sa.3, ss.248-259, 2021 (ESCI)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
2025IDENTIFICATION OF POTENTIAL EPITOPES FOR THE DEVELOPMENT OF A PEPTIDEBASED VACCINE AGAINST NIPAH VIRUS THROUGH BIOINFORMATICS APPROACHES
Saygılı İ., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
ARCENG III. INTERNATIONAL SCIENTIFIC RESEARCH CONGRESS, İstanbul, Türkiye, 1 - 02 Şubat 2025, ss.145-160
2025
2025MUTATION ANALYSIS OF NUCLEOPROTEIN, VP35, VP30, AND L PROTEINS OF THE MARBURG VIRUS AND IN SILICO EVALUATION OF THEIR POTENTIAL AS VACCINE CANDIDATES
Tarhan B., Öztürk S., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
ARCENG III. INTERNATIONAL SCIENTIFIC RESEARCH CONGRESS, İstanbul, Türkiye, 1 - 02 Şubat 2025, ss.161-168
2024
2024Structural Dynamics and Pharmacological Interactions of SLITRK1 Protein
Aktaş E., Yıldız D., Islim A. R., Özdemir Özgentürk N.
2ND MEETING ON MACHINE LEARNING AND NON-GLOBULAR PROTEINS | 2024, Thessaloniki, Yunanistan, 14 - 17 Mayıs 2024, ss.41-42
2023
2023Exploring Axolotl Regeneration: Bioinformatic Insights into the Wnt/ß-Catenin Pathway and ProteinVitamin Interactions for Advancing Regenerative Medicine
Aktaş E., Koç B. B., Özdemir Özgentürk N.
6th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences, Ankara, Türkiye, 11 - 13 Ekim 2023, ss.1489, (Özet Bildiri)
2023
2023Bioinformatics analysis of miRNA expression profile according to gender in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis patients
Aktaş E., Şahin K. N., Sever T., Özdemir Özgentürk N.
6th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences, Ankara, Türkiye, 11 - 13 Ekim 2023, ss.1488
2023
2023Determination of Possible Mutation-prone Positions and Effects of SLITRK Protein in Silico
İslim A., Yıldız D., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
3 th International Congress of Engineering and Natural Sciences Studies, Ankara, Türkiye, 24 - 25 Mayıs 2023, ss.122
2023
2023Determination of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in Human CAPN3 Gene by In Silico Analysis
Kayışlı G., Dilemek B., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
3 th International Congress of Engineering and Natural Sciences, Ankara, Türkiye, 24 - 25 Mayıs 2023, ss.417-426
2023
2023BIOINFORMATICS INVESTIGATION OF THE STRUCTURE OF AROMATASE ENZYME RELATED WITH BREAST CANCER
Aktaş E., Karyemez E., Özdemir Özgentürk N.
CUMHURIYET 8th INTERNATIONAL CONFERENCE ON APPLIED SCIENCES, Ankara, Türkiye, 23 Nisan 2023, ss.13
2023
2023FINDING GENES RELATED WITH FEMALE INFERTILITY LIKE WNT4 AS A RESULT OF BIOINFORMATIC ANALYSIS
Aktaş E., Kayım E., Özdemir Özgentürk N.
CUMHURIYET 8th INTERNATIONAL CONFERENCE ON APPLIED SCIENCES , Ankara, Türkiye, 23 Nisan 2023, ss.14
2022
2022Bioinformatics Analysis of ANGPTL4 Mediating Inactivation of Lipoprotein Lipase LPL
Aktaş E., Özdemir Özgentürk N., Malkoç M., Bilir E.
International Congress of Medical and Health Sciences Studies, Ankara, Türkiye, 13 Aralık 2022, ss.198
2022
2022Bioinformatics Analysis of ANGPTL4 Mediating Inactivation of Lipoprotein Lipase LPL
AKTAŞ E., ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK N., Malkoç M., Bilir E.
International Congress of Medical and Health Sciences Studies, Ankara, Türkiye, 13 Aralık 2022, cilt.1, ss.438-450
2022
2022IDENTITY OF ACE2 AS A RESULT OF BIOINFORMATIC INVESTIGATIONS
Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
CUMHURIYET 6th INTERNATIONAL CONGRESS ON APPLIED SCIENCES, Ankara, Türkiye, 23 Nisan 2022, ss.2
Kitaplar
2024
2024The Role of MicroRNAs (MiRNAs) in Neurodegenerative Diseases
Şahin K. N., Sever T., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
THE BROAD SPECTRUM OF BIOLOGICAL SCIENCES, Dr. Sevgi MARAKLI,Dr. Merve YILMAZER, Editör, Gaziantep University Press, Gaziantep, ss.475-491, 2024
2024
2024INVESTIGATION OF THE INTERACTION OF THE DRUG SEMAGLUTIDE (OZEMPIC, RYBELSUS) WITH OUTER MEMBRANE PROTEINS OF GUT BACTERIA IN SILICO
Özcan A. M., Aydın M., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
II. INTERNATIONAL SCIENCES CONGRESS-CONFERENCE BOOK, ASSIST. PROF. BURCU OZUBERK, Editör, ARCENG PUBLICATIONS, Eskişehir, ss.5-10, 2024
2024
2024DETERMINATION OF MUTATIONS IN THE GLYCOPROTEIN, VP24 AND VP40 PROTEINS IN THE MARBURG VIRUS AND INVESTIGATION IN SILICO OF THE INTERACTION OF THE GLYCOPROTEIN WITH ITS TAM FAMILY THAT CAUSES ITS INTRODUCTION TO THE HUMAN BODY
Öztürk S., Tarhan B., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
ARCENG INTERNATIONAL SCIENTIFIC RESEARCH CONFERENCE, ASSIST. PROF. BURCU OZUBERK, Editör, ARCENG PUBLICATIONS,, Eskişehir, ss.11-22, 2024
2024
2024İLERİ DÜZEYDE MULTİPLE SKLEROZ HASTALIĞINDA EKSPRESYONU ARTAN miRNA’LARIN ARALARINDAKİ ETKİLEŞİMİN VE İLİŞKİLİ OLABİLECEK miRNA’LARIN İNCELENMESİ
Sever T., Şahin K. N., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
ARCENG INTERNATIONAL SCIENTIFIC RESEARCH CONFERENCE, ASSOC. PROF. SECIL KARTOPU, Editör, ARCENG PUBLICATIONS –2024, İstanbul, ss.58-67, 2024
2023
2023In Silico Identification of Possible Mutation-Prone Regions of the GRIA3 Protein
Keskin Z. N., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
Current Debates on Natural and Engineering Sciences 9, Hikmet Y. ÇOĞUN,İshak PARLAR,Hasan ÜZMUŞ, Editör, Bilgin Kültür Sanat Yayınları, Ankara, ss.73-79, 2023
2022
2022Bioinformatics Analysis of ANGPTL4
Bilir E., Malkoç M., Aktaş E., Özdemir Özgentürk N.
Current Debates on Health Sciences 4, Recep Akkaya,Birnur Akkaya, Editör, Bilgin Kültür Sanat Yayınları, Ankara, ss.438-450, 2022
Desteklenen Projeler
2023 - 2026
2023 - 2026Biyoinformatik Olarak Tasarlanmış Modifiye ACE2 Protein ve Peptidlerin COVID-19 Hastalığına Karşı İnhibitör Ajan Potansiyelinin In vitro Değerlendirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Özdemir Özgentürk N. (Yürütücü), Özbek T., Aktaş E., Derman S., Pelit Arayıcı P.
2024 - 2024
2024 - 2024Marburg Virüsüne Ait Nükleoprotein, Vp35, Vp30 Ve L Proteinlerinde Mutasyon Belirleme Ve Bu Proteinlerin Aşı Adaylığının İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Tarhan B.(Yürütücü), Aktaş E.
2024 - 2024
2024 - 2024Semaglutid (Ozempic, Rybelsus) ilacının insan bağırsaklarında bulunan bakterilerin dış membran proteinleri ile etkileşiminin in siliko ortamda incelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Özcan A. M.(Yürütücü), Aktaş E.
2024 - 2024
2024 - 2024Marburg Virüsündeki Glikoprotein , Vp24 Ve Vp40 Proteinlerinde Mutasyonlarının Belirlenmesi Ve Glikoproteinin İnsan Vücuduna Girmesine Sebep Olan Tam Ailesi İle Etkileşiminin İn Silico Olarak İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Öztürk S.(Yürütücü), Aktaş E.
2023 - 2024
2023 - 2024
Üçlü Negatif Meme Kanserine Neden Olan Reseptörlerin Yapılarının Biyoinformatik Olarak İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Aldoğan E.(Yürütücü), Aktaş E.
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
21 Mayıs 2024 - 23 Mayıs 2024
21 Mayıs 2024 - 23 Mayıs 2024ESFLU second annual scientific and networking meeting
Katılımcı
Thessaloniki-Yunanistan
14 Mayıs 2024 - 17 Mayıs 2024
14 Mayıs 2024 - 17 Mayıs 20242ND ML4NGP MEETING ON MACHINE LEARNING AND NON-GLOBULAR PROTEINS
Katılımcı
Thessaloniki-Yunanistan
13 Şubat 2024 - 16 Şubat 2024
13 Şubat 2024 - 16 Şubat 2024